Minh Ganther

Kontakt / Adresse


Minh Ganther
Doktorandin

Department Bodenökologie
Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung - UFZ
Theodor-Lieser-Str. 4 | 06120 Halle/Saale

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Mitarbeiter


Aktuelles Forschungsprojekt

Spatiotemporal analysis of maize root gene expression patterns

SPP2089 Projekt ROOTGENES

Mein PhD-Projekt ist im interdisziplinären DFG-Schwerpunktprogramm Rhizosphere Spatiotemporal Organisation - a Key to Rhizosphere Functions (SPP2089) angesiedelt. In diesem übergeordneten Projekt arbeiten Forschungsgruppen der Themenbereiche Bodenphysik, Bodenchemie, Pflanzenphysiologie, Mikrobiologie und Modelling gemeinsam an der Aufklärung von Strukturmustern in räumlicher und zeitlicher Auflösung innerhalb der Rhizosphäre von Zea mays (Mais). Hierbei werden Klimakammer-Experimente unter streng kontrollierten Bedingungen mit Feld-Probenahmen kombiniert, um früh bzw. spät hervortretende funktionelle Eigenschaften zu analysieren.

Wurzelsystem von Mais in Klimakammerversuch (Feb 2019)
Feld-Probenahme an Rhizofenstern in Bad Lauchstädt (Sep 2019)

Mein Projekt (ROOTGENES) beschäftigt sich mit den Genexpressions-Mustern der Maiswurzeln, die aufgrund verschiedener variierender Parameter hervortreten, unter anderem Bodentyp, Pflanzengenotyp, und Interaktionen mit dem Mikrobiom.

Die wesentlichen Fragestellungen sind:

  1. Wie beeinflusst die räumliche Organisation der Wurzel die pflanzliche Genexpression im Bezug auf das Mikrobiom und inwiefern wirken sich Bodeneigenschaften und Wurzelhaarbildung darauf aus?
  2. Spiegelt sich die lokale und zeitliche Umstrukturierung der Rhizosphäre durch Veränderungen in der Genexpression wieder, vor allem in funktionellen Kategorien wie Wahrnehmung von Mikroorganismen, Abwehr-Signalgebung, Exsudation und Nährstoffaufnahme?

Kooperationen

SPP2089 Project P16 Rhizosphere Microbiome

Partners: Dr. Bunlong Yim, Prof. Dr. Kornelia Smalla (Julius-Kühn-Institut, Braunschweig)

Einfluss von pflanzenwachstumsfördernden Bakterienstämmen auf das Bodenmikrobiom und Maiswurzel-Genexpression in Abhängigkeit externer Faktoren (Bodentyp, Wurzelgenotyp, Beprobungstiefe)

SPP2089 Project P14 Protist Microbiota

Partners: Lioba Rüger, Prof. Dr. Michael Bonkowski (Universität Köln, Köln)

Bakterien- und Protozoa-Gemeinschaften entlang der Mais-Wurzelzonen und Einfluss von Wurzelhaube / Wurzelhaaren


Lebenslauf

seit 2018

PhD Student an der Universität Leipzig und angestellt am Department Bodenökologie des Helmholtz-Zentrums für Umweltforschung (UFZ), Halle
(Betreut durch: PD Dr Mika Tarkka)

2014–2017

M.Sc. in Biochemie, Universität Leipzig
Thema der Masterthesis: "Charakterisierung der NPY-Rezeptoren in murinen hypothalamischen Zellen"

2011–2014

B.Sc. in Biochemie, Universität Leipzig
Titel der Bachelorthesis: "Untersuchung der NPY-Bindungstasche am humanen Y1-Rezeptor"


Konferenzbeiträge

Poster

Minh Ganther, Marie-Lara Bouffaud, Lucie Gebauer, François Buscot, Doris Vetterlein, Anna Heintz-Buschart, Mika Tarkka. Spatial sampling approach to unravel the impact of soil texture and root genotype on maize root gene expression profiles. EGU General Assembly 2020. Online virtual conference. doi:10.5194/egusphere-egu2020-9707.

Minh Ganther, Zeeshan Ibrahim, Bunlong Yim, Eva Lippold, Doris Vetterlein, Anna Heintz-Buschart, Evgenia Blagodatskaya, Kornelia Smalla, Mika Tarkka. Effects of X-ray Computed Tomography on Root Transcriptome and Rhizosphere Microbiota. Botanikertagung 2019. Rostock, Deutschland.