Dr. Regina Stoltenburg 

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Dr. Regina Stoltenburg
Wissenschaftliche Mitarbeiterin

Department Bodenökologie
Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung - UFZ
Theodor-Lieser-Str. 4 | 06120 Halle/Saale

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Regina Stoltenburg

aktuelle Forschungsinteressen

Mikrobielle Diversität – die unsichtbare Vielfalt
  • mikrobielle Gemeinschaften (Bakterien, Pilze) im Boden
  • Effekte unterschiedlicher Landnutzungsstrategien und zukünftiger klimatischer Entwicklungen auf die Diversität und Struktur der mikrobiellen Gemeinschaften
  • saisonale Dynamiken
  • molekulare Methoden (Amplicon‐Sequenzierung) und Datenanalyse
Microbial Diversity, Grafik: R. Stoltenburg/UFZ
Experimentelle Plattform

GCEF ‐ Global Change Experimental Facility
Feldexperiment zur Untersuchung der Folgen des Klimawandels für Ökosystemprozesse in verschiedenen Landnutzungstypen

GCEF

weitere Forschungsinteressen (Schwerpunkte in der Vergangenheit)


Forschungsprojekte

  • Internationale Wasserforschungsallianz Sachsen (IWAS I, II), Teilprojekt: Entwicklung eines Multisensorsystems zum Nachweis von pathogenen Mikroorganismen
    BMBF-Verbundvorhaben (02WM1027, 02WM1165), Laufzeit: 2008 – 2012

    Kooperation: TU Dresden / Fraunhofer IWS Dresden

  • Portables Messsystem zum Nachweis von Arzneimittelreststoffen in Wässern, Teilprojekt: Aptamere für Arzneimittelreststoffe
    AiF PRO INNO II (KF0011004DA6), Laufzeit: 2006 – 2008

    Kooperation: AMTEC Analysenmesstechnik GmbH

  • Neue Ansätze zur Diagnose der sporadischen Alzheimer-Krankheit und der neuen Variante der Creutzfeldt-Jakob-Krankheit, Teilprojekt: Entwicklung von Aptameren
    SMWK / EFRE (4-0123.55-20-0361-04/8, Projekt-Nr.: 4212/04-14), Laufzeit: 2004 – 2006

    Kooperation: Universität Leipzig (Koordination), Labor Diagnostik GmbH

  • Entwicklung von Aptameren für Biosensoren
    SMUL (13-8811.61/93), Laufzeit: 2001 – 2003

    Kooperation: Ingenieurbüro für Verpackung (IBV), Dresden

  • Neue Biosensoren zur Bestimmung halogenierter Organika
    GIF (I 0442-168.03./95), Laufzeit: 1999 – 2000
    Kooperation: Hebrew University in Jerusalem, Universität Stuttgart


Redaktionelle Tätigkeiten

Reviewer

  • für verschiedene wissenschaftliche Zeitschriften, z. B. PLOS ON, Scientific Reports, ACS Omega, Biochimie, Journal of Microbiological Methods, Chemosensors, Analytical Chemistry, Analytical Biochemistry


Gast-Editor

  • MDPI Sensors | Special issue "Aptamers and Applications" 2018/2019 Available Online
  • MDPI Sensors | Special issue " Recent Advances and Emerging Applications of Aptamers " 2020/2022 Available Online


Wissenschaftlicher Werdegang

seit 2014

Wissenschaftlerin am Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung – UFZ, Halle (Dept. Bodenökologie)

2006 - 2014

Wissenschaftlerin am Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung – UFZ, Leipzig (Dept. UBZ, AG Aptamers and Applications)

2004 - 2006

Wissenschaftlerin an der Universität Leipzig (Fakultät für Chemie und Mineralogie, Bioanalytik, BBZ) und Gastwissenschaftlerin am UFZ in der AG Aptamers and Applications

1999 - 2004

Wissenschaftlerin am Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung – UFZ, Leipzig (Dept. UBZ, AG Aptamers and Applications)

1996 - 1999

Wissenschaftlerin am Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK) Gatersleben (AG Hefegenetik)

Doktorarbeit

1992 - 1996

Doktorandin am IPK Gatersleben (AG Hefegenetik),
Promotion im Fachgebiet Biochemie an der EMAU Greifswald zum Thema „Untersuchungen zu einem Sec1p- und Sec7p-unabhängigen Proteintransportweg bei Saccharomyces cerevisiae am Beispiel des Glykoproteins gp115”

Diplom in Biologie (Schwerpunkt: Mikrobiologie)

1992

Ernst-Moritz-Arndt-Universität (EMAU) Greifswald / Teilstudium an der RWTH Aachen, Institut für Biologie IV,
Diplomarbeit: „Molekularbiologische Untersuchungen zur Diversität der Hefe Candida utilis


Liste an Publikation und Patenten

Stoltenburg, R., Strehlitz, B. (2018): Refining the Results of a Classical SELEX Experiment by Expanding the Sequence Data Set of an Aptamer Pool Selected for Protein A. Int. J. Mol. Sci. 2018, 19, 642. DOI: 10.3390/ijms19020642
Journal

Reich, P., Stoltenburg, R., Strehlitz, B., Frense, D., Beckmann, D. (2017): Development of An Impedimetric Aptasensor for the Detection of Staphylococcus aureus. Int. J. Mol. Sci. 18: 2484. DOI: 10.3390/ijms18112484
Journal

Certificate_Best Research Article_IJMS Award 2018 This article was selected by the journal's editorial board members as one of the Best Research Papers published in IJMS 2017.
IJMS 2018 Best Paper Award



Stoltenburg, R., Krafčiková, P., Víglaský, V., Strehlitz, B. (2016): G-quadruplex aptamer targeting Protein A and its capability to detect Staphylococcus aureus demonstrated by ELONA. Scientific Reports 6: 33812. DOI: 10.1038/srep33812
Journal

Stoltenburg, R., Schubert, T., Strehlitz, B. (2015): In vitro Selection and Interaction Studies of a DNA Aptamer Targeting Protein A. PLoS ONE 10 (7): e0134403. DOI: 10.1371/journal.pone.0134403
Journal

Online-Presentation of the article "In vitro Selection and Interaction Studies of a DNA Aptamer Targeting Protein A" (PLoS ONE 2015, 10(7):e0134403) by Global Medical Discovery, 02-Nov-2015.
Website

Heilkenbrinker, A., Reinemann, C., Stoltenburg, R., Walter, J.-G., Jochums, A., Stahl, F., Zimmermann, S., Strehlitz, B., Scheper, T. (2015): Identification of the Target Binding Site of Ethanolamine-Binding Aptamers and Its Exploitation for Ethanolamine Detection. Anal. Chem. 87: 677-685. DOI: 10.1021/ac5034819
Journal

Tröger, V., Strehlitz, B., Stoltenburg, R., Schmieder, S., Sonntag, F. (2013): Charakterisierung von Protein A-spezifischen DNA-Aptameren mittels SPR. 11. Dresdner Sensor-Symposium, December 2013, Dresden, Germany. Conference paper, Chapter: 1. Biosensorik und Point of Care: 178-182. DOI: 10.5162/ 11dss2013/A12
Conference Website

Strehlitz, B., Reinemann, C., Linkorn, S., Stoltenburg, R. (2012): Aptamers for pharmaceuticals and their application in environmental analytics. Bioanal. Rev. 4: 1-30. DOI: 10.1007/s12566-011-0026-1
Journal

Stoltenburg, R., Nikolaus, N., Strehlitz, B. (2012): Capture-SELEX: selection of DNA aptamers for aminoglycoside antibiotics. J. Anal. Methods Chem. 2012: 415697. DOI:10.1155/2012/415697
Journal

Ruigrok, V., van Duijn, E., Barendregt, A., Dyer, K., Tainer, J., Stoltenburg, R., Strehlitz, B., Levisson, M., Smidt, H., van der Oost, J. (2012): Kinetic and Stoichiometric Characterisation of Streptavidin‐Binding Aptamers. ChemBioChem. 13 (6): 829-836. DOI: 10.1002/cbic.201100774
Journal

Stoltenburg, R., Reinemann, C., Strehlitz, B. (2010): Erkennung von Umweltschadstoffen durch DNA-Aptamere. Laborwelt. 11. Jahrgang, Nr. 2 / 2010: 6-9.
Journal

*Reinemann, C., *Stoltenburg, R., Strehlitz, B. (2009): Investigations on the Specificity of DNA Aptamers Binding to Ethanolamine. Anal. Chem. 81: 3973-3978. DOI: 10.1021/ac900305y
(*gleichberechtigte Autorenschaft)
Journal
 
Strehlitz, B., Nikolaus, N., Stoltenburg, R. (2008): Protein Detection with Aptamer Biosensors. Sensors 8: 4296-4307. DOI: 10.3390/s8074296
Journal

Strehlitz, B., Stoltenburg, R. (2008): Neue Methoden zur Schadstoff-Analytik. Ingenieur-Nachrichten. Ausgabe 02/2008: 5.

Stoltenburg, R., Reinemann, C., Strehlitz, B. (2007): SELEX - a (r)evolutionary method to generate high affinity nucleic acid ligands. Biomol. Eng. 24: 381-403. DOI: 10.1016/j.bioeng.2007.06.001
Journal

Stoltenburg, R., Reinemann, C., Strehlitz, B. (2006): DNA Aptamer Selection Using a Ligand Evolution Process. American Biotechnology Laboratory. January, Vol. 24, No. 1: 18-20.

Mann, D., Reinemann, C., Stoltenburg, R., Strehlitz, B. (2005): In vitro selection of DNA aptamers binding ethanolamine. Biochem. Biophys. Res. Commun. 338: 1928-1934. DOI: 10.1016/j.bbrc2005.10.172
Journal

Stoltenburg, R., Reinemann, C., Strehlitz, B. (2005): FluMag-SELEX as an advantageous method for DNA aptamer selection. Anal. Bioanal. Chem. 383: 83-91. DOI: 10.1007/s00216-005-3388-9
Journal

Stoltenburg, R., Strehlitz, B. (2003): Entwicklung von Aptameren für Biosensoren. UFZ-Bericht Nr. 13/2003, ISSN 0948-9452.

Wartmann, T., Stoltenburg, R., Böer, E., Sieber, H., Bartelsen, O., Gellissen, G. and Kunze, G. (2003): The ALEU2 gene – a new component for an Arxula adeninivorans based expression platform. FEMS Yeast Research 3: 223-232. DOI: 10.1016/S1567-1356(02)00190-3
Journal

Wartmann, T., Stephan, U.W., Bube, I., Böer, E., Melzer, M., Manteuffel, R., Stoltenburg, R., Guengerich, L., Gellissen, G. and Kunze, G. (2002): Post-translational modifications of the AFET3 gene product – a component of the iron transport system in budding cells and mycelia of the yeast Arxula adeninivorans. Yeast 19: 849-862. DOI: 10.1002/yea.880
Journal

Yang, X.-X., Wartmann, T., Stoltenburg, R., Kunze, G. (2000): Halotolerance of the yeast Arxula adeninivorans LS3. Antonie van Leeuwenhoek 77: 303-311. DOI: 10.1023/A:1002636606282
Journal

Kunze, I., Hensel, G., Adler, K., Bernard, J., Neubohn, B., Nilsson, C., Stoltenburg, R., Kohlwein, S.D., Kunze, G. (1999): The green fluorescent protein targets secretory proteins to the yeast vacuole. Biochim. Biophys. Acta 1410: 287-298. DOI: 10.1016/S0005-2728(99)00006-7
Journal

Stoltenburg, R., Lösche, O., Klappach, G. and Kunze, G. (1999): Molecular cloning and expression of the ARFC3 gene, a component of the replication factor C from the salt tolerant, dimorphic yeast Arxula adeninivorans LS3. Curr. Genet. 35: 8-13. DOI: 10.1007/s002940050426
Journal

Kühnel, C., Stoltenburg, R., Kunze, I. and Kunze, G. (1996): Long-term effects of restrictive culture conditions on Saccharomyces cerevisiae sec7 cells. Microbiol. Res. 151: 93-97. Doi: 10.1016/S0944-5013(96)80062-0
Journal

Stoltenburg, R., Wartmann, T., Kunze, I. and Kunze, G. (1995): Reliable method to prepare RNA from free and membrane-bound polysomes from different yeast species. BioTechniques 18: 564-568.
Journal

Stoltenburg, R., Klinner, U., Ritzerfeld, P., Zimmermann, M. und Emeis, C.C. (1992): Genetic diversity of the yeast Candida utilis. Curr. Genet. 22: 441-446. DOI: 10.1007/BF00326408
Journal

Strehlitz, B., Stoltenburg, R. (2009): SELEX and its Recent Optimizations. In: Mascini, M., (Ed.), Aptamers in Bioanalysis. John Wiley & Sons, Inc., pp. 31-59.
Website

Stoltenburg, R., Reinemann, C., Strehlitz, B. (2007): Development of Aptamers as New Receptors for Environmental Biosensors. In: Mishra, C.S.K. and Juwarkar, A.A., (Ed.), Environmental Biotechnology. APH Publishing Corporation, New Delhi, pp. 83-112.

Reinemann, C., Strehlitz, B., Stoltenburg, R.: Fluorchinolon-spezifische Aptamere. Deutsches Patent DE 102013 204 057.1, Anmeldetag: 08.03.2013, Deutsches Patent- und Markenamt, München.
Internationales Patent EP2774988B1, Anmeldetag: 04.03.2014, Europäisches Patentamt.

Nikolaus, N., Prange, A., Stoltenburg, R., Strehlitz, B.: Aminoglycosid spezifische Aptamere. Deutsches Patent DE 102011006612.8, Anmeldetag: 31.03.2011, Deutsches Patent- und Markenamt, München.
Internationales Patent EP2691523, Anmeldetag: 29.03.2012, Europäisches Patentamt.

Stoltenburg, R., Strehlitz, B.: Aptamere, die spezifisch sind für Immunglobulin bindende Zellwandproteine. Deutsches Patent DE 102011006610.1, Anmeldetag: 31.03.2011, Deutsches Patent- und Markenamt, München.
Internationales Patent PCT/EP2012/055655, Anmeldetag: 29.03.2012, Europäisches Patentamt.
US-Patent 9,353,421 B2, Anmeldetag: 29.03.2012, United States Patent and Trademark Office (USPTO).

Stoltenburg, R., Strehlitz, B., Reinemann, C.: Tau-Protein spezifische Aptamere, deren Verwendung sowie ein Kit umfassend solche Aptamere. Deutsches Patent DE 10 2010 038 842.4, Anmeldetag: 03.08.2010, Deutsches Patent- und Markenamt, München.

Strehlitz, B., Mann, D., Reinemann, C., Stoltenburg, R.: Ethylaminspezifische Aptamere, deren Verwendung und ein Kit umfassend diese Aptamere. Deutsches Patent DE 10 2005 052 275.0, Anmeldetag: 27.10.2005, Deutsches Patent- und Markenamt, München.

Strehlitz, B., Stoltenburg, R.Gründig, B.: Elektrochemischer Nachweis von Nukleinsäuren. Deutsches Patent DE 102 56 898.7, Anmeldetag: 29.11.2002, Deutsches Patent- und Markenamt, München.

Kunze, G., Walter, I., Rösel, H., Böer, E., Stoltenburg, R., Wartmann, T., Bui, M.D.: Method for synthesizing proteins in a yeast of the genus Arxula and suitable promoters. US Patent US 2003/0186376, Anmeldetag: 08.11.2002.

Kunze, G., Walter, I., Rösel, H., Böer, E., Stoltenburg, R., Wartmann, T., Bui, MD.: Verfahren zum Herstellen von Proteinen in einer Hefe der Gattung Arxula und dafür geeignete Promotoren. Deutsches Patent DE 501 15 564.3, Anmeldetag: 08.05.2001, Deutsches Patent- und Markenamt, München.
Internationales Patent PCT/EP2001/005225, Anmeldetag: 08.05.2001, Europäisches Patentamt.