Dr. Christina Weißbecker

Kontakt / Addresse


Dr. Christina Weißbecker
Wissenschaftliche Mitarbeiterin

Abteilung Bodenökologie
Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung
Theodor-Lieser-Straße 4 | 06120 Halle/Saale

Tel.:
Email:

Christina Weißbecker

Aktuelle Projekte

Mich interessiert die Biodiversität und die Interaktion der mikrobiellen Bodenorganismen und deren Einfluss auf Ökosystemfunktionen. Zukünftig möchte ich meine Analysen gern auf weitere Bodenorganismen und trophische Ebenen ausweiten um die große Komplexität von Wechselwirkungen zwischen den Bodenorganismen und der oberirdischen Vegetation besser abbilden und verstehen zu können.  

Zur Charakterisierung der mikrobiellen Gemeinschaften nutze ich aktuelle Hochdurchsatz-Sequenziermethoden für die Amplikon Sequenzierung von Markergenen mittels Metabarcoding. Die Sequenziertechnologien und bioinformatischen Tools entwickeln sich rasant weiter und meine Arbeit schließt ebenso die Optimierung der Datenaufbereitung und das Testen neuer Tools  mit ein, die zumeist die Nutzung des High Perfomance Computer Clusters "EVE" des UFZ erfordern.

Im Rahmen des GFBIO Projektes setzte ich mich ebenso mit dem Datenmanagement nach den FAIR Prinzipien auseinander und strebe bei meinen Publikationsprojekten eine gute Dokumentation der Analysen durch Veröffentlichung aller Daten, Metadaten, bioinformatischen und statistischen Skripte an sowie die Publikation der  Manuskripte als frei zugängliche OpenAcess Dokumente.

Meine Dokotorarbeit "Biodiversity and assembly processes of soil fungal communities in Chinese subtropical forests with variable tree diversity" erfolgte im Rahmen des Biodiversity-Ecosystem Functioning Experiments China ( BEF-China ), das derzeit als TreeDì   Projekt weitergeführt wird.
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Lebenslauf

seit 2018 Wissenschaftliche Mitarbeiterin
Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung Halle -UFZ, Abteilung Bodenökologie.

Bioinformatische Auswertung und Pipeline- Entwicklung zu Amplikonsequenzierdaten verschiedener Sequenzierplattformen.
2011 - 2020 Doktorarbeit in der Abteilung Bodenökologie, Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung Halle -UFZ.

Titel: "Biodiversity and assembly processes of soil fungal communities in Chinese subtropical forests with variable tree diversity"
2005 - 2011 Dipl.-Ing. Biotechnologie, Technische Universität Berlin. Spezialisierung Mikrobiologie und Molekularanalytik.

Diplomarbeit: "Metagenomic analysis of Dehalococcoides-related Chloroflexi enriched from marine sediments" (Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung -UFZ, Abteilung Isotopenbiogeochemie, Leipzig).

  • Annual Conference of the Association for General and Applied Microbiology (VAAM), 17.03-20.03.2019, Mainz
  • International Conference on Ecological Informatics (10. ICEI), 24.09-28.09.2018, Jena
  • Ecology of Soil Microorganisms (2. ESM),  29.11- 03.12.2015, Prag
  • International Conference on Mycorrhiza (7. ICOM), 6-11. Januar 2013, Neu-Delhi
  • Jährliches Treffen der Gesellschaft für Ökologie Deutschland, Österreich und der Schweiz (42. GfÖ), 10. -14. September 2012, Lüneburg
  • Weißbecker, C., B. Schnabel, A. Heintz-Buschart. (2020, preprint): Efficiently processing amplicon sequencing data for microbial ecology with dadasnake, a DADA2 implementation in Snakemake. bioRxiv 2020.05.17.095679; doi: 10.1101/2020.05.17.095679            
  • Weißbecker, C., A. Heintz-Buschart, H. Bruelheide, F. Buscot, T. Wubet. (2019): Linking Soil Fungal Generality to Tree Richness in Young Subtropical Chinese Forests. Microorganisms. doi: 10.3390/microorganisms7110547
  • Weißbecker, C., T. Wubet, G. Lentendu, P. Kühn, T. Scholten, H. Bruelheide,  F. Buscot. (2018): Experimental evidence of functional group-dependent
    effects of tree diversity on soil fungi in subtropical forests. Frontiers in Microbiology. doi: 10.3389/fmicb.2018.02312
  • Trogisch, S., A. Schuldt, J. Bauhus, J.A. Blum, S. Both, F. Buscot, N. Castro-Izaguirre, D. Chesters, W. Durka, D. Eichenberg, A. Erfmeier, M. Fischer, C. Geißler, M.S. Germany, P. Goebes, J.Gutknecht, C.Z. Hahn, S. Haider, W. Härdtle, J.-S. He, A. Hector, L. Hönig, Y. Huang, A.-M. Klein, P. Kühn, M. Kunz, K.N. Leppert, Y. Li, X. Liu, P. A. Niklaus, Z. Pei, K.A. Pietsch, R. Prinz, T. Proß, M. Scherer-Lorenzen, K. Schmidt, T. Scholten, S. Seitz, Z. Song, M. Staab, G. von Oheimb, C. Weißbecker, E. Welk, C. Wirth, T. Wubet, B. Yang, X. Yang, C.-D Zhu, B. Schmid, K. Ma, H. Bruelheide. (2017). Toward a methodical framework for comprehensively assessing forest multifunctionality. Ecology and Evolution. doi: 10.1002/ece3.3488
  • Weißbecker, C., F. Buscot, T. Wubet.(2017). Preservation of nucleic acids by freeze-drying for next generation sequencing analyses of soil microbial communities. Journal of Plant Ecology. doi: 10.1093/jpe/rtw042