Analytische Methoden

1. Gezielte Metabolom-Analysen ermöglichen die genaue Identifizierung und Quantifizierung von vorher ausgewählten Verbindungen wie Stoffwechselprodukten oder Chemikalien. In unserer Arbeitsgruppe verwenden wir dafür vorranging Triple-quadrupole Massenspektrometer gekoppelt an Flüssigkeitschromatographie-Systeme (nähere Informationen).   
   
2. Isotopenmarkierte Flux-Analysen ermöglichen es, ein isotopenmarkiertes Stoffwechselprodukt wie Glucose, Aminosäuren oder Fettsäuren durch den Stoffwechsel zu verfolgen. Üblicherwesie warden dafür markierte Kohlenstoff- (13C), Stickstoff- (15N) oder Wasserstoff- (2H) quellen verwendet (nähere Informationen).
3. Ungerichtete Metabolom-Analyse erlaubt ein globales Screening von bekannten und unbekannten Metaboliten in einer Probe. In unserer Arbeitsgruppe haben wir Zugang zu einer hochauflösenden (nähere Informationen).   
   
4. 16S rRNA Genprofile sind eine gängige Methode zur Bestimmung der relative Höufigkeit von Bakterientaxa in mikrobiellen Gemeinschaften. Dafür wird das 16S rRNA-Gen, welches in allen Bakterien vorkommt, sequenziert und relativ quantifiziert (nähere Informationen).
5. Metatranskriptom-Analyse ist eine leistungsfähige Methode zur Bestimmung der Taxonomie von mikrobiellen Gemeinschaften und deren Funktionen. Die Methode basiert auf der Analyse des gesamten Transkript-Satzes der Gemeinschaft (nähere Informationen).