Software

INDICATE

Indicate Logo

Indicate ist eine Web-Anwendung zur Bewertung von Stresswirkungen auf Ökosysteme. Sie umfasst Werkzeuge wie Bioindikatoren und Modelle zru Analyse von Umweltdaten.


tfp-browser

tfp browser

Der "Toxicogenomic Fingerprint Browser" (tfp-browser) ist ein auf R Shiny basierendes Tool zur Exploration und Visualisierung von toxikogenomischen Daten des gesamten Transkriptoms des Zebrafisch-Embryo-Modells. Aktuell können die Wirkmuster von über 70 Substanzen untersucht werden.  

INTOB

Integrated Effect Database for Toxicological Observations

INTOB ist eine Software zur Erfassung von toxikologischen Beobachtungsdaten und Metadaten unter unter Berücksichtigung der FAIR-Prinzipien („findable, accessible, interoperable,reproducible“). Die webbasierte Softwarelösung INTOB ermöglicht die Verwaltung von beobachtungsbasierten Toxizitätsdaten, gängiger Metadaten-Erfassungs-Standards, sowie Datenschutz-Richtlinien über eine entsprechende Nutzerverwaltungsdomäne.

FishInspector

FishInspector
Die FishInspector-Software ermöglicht die benutzerfreundliche und einfache Beschriftung von Merkmalen in zweidimensionalen Bildern von Zebrafisch-Embryonen. Die Merkmale werden mit Hilfe von Deep-Learning-Modellen automatisch erkannt, müssen aber möglicherweise vom Benutzer korrigiert werden.