AG Antibiotikaresistenzen in der Umwelt (Dr. Anja Worrich)
Maja Hinkel
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- Isolation, Anreicherung, Kultivierung und Quantifizierung aerober und anaerober Bakterien
- Extraktion von DNA, RNA und Proteinen
- PCR, qPCR, epicPCR
- Fluoreszenz- und Lichtmikroskopie
- FISH
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AG Bioverfügbarkeit (Dr. Lukas Wick)
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Jana Reichenbach |
- Isolation, Anreicherung, Kultivierung und Quantifizierung aerober Mikroorganismen (Pilze und Bakterien)
- Hochdurchsatz-Quantifizierung von Bakterien mittels Spiralplattierung und automatischer Kolonieauszählung
- Bestimmung der Oberflächenhydrophobizität mikrobieller Oberflächen (Kontaktwinkelmessungen)
- Bestimmung der Oberflächenspannung von Lösungen
- Bestimmung des Schwimmverhaltens von Bakterien (Chemotaxie, Schwimm- und Schwärmverhalten)
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Birgit Würz |
- Isolation, Anreicherung, Kultivierung und Quantifizierung aerober Mikroorganismen (Pilze und Bakterien)
- Chemische Analytik organischer Stoffe: GC-FID, GC-ECD, GC-MS, Headspace
- Extraktion und Analyse organischer Spurenstoffe
- Bestimmung der Partikelgröße, Partikelkonzentration und der phys.-chem. Oberflächeneigenschaften (Isoelektischer Punkt, Zeta-Potenzial) von Bio-Kolloiden und Makromolekülen (Zeta-Sizer ULTRA)
- Webseiten-Design und -Pflege
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AG Flow Cytometrie (Prof. Dr. Susann Müller)
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Florian Schattenberg |
- Zytometrie
- Zellsortierung
- DNA-Extraktion, PCR- und T-RFLP- Fingerprinting
- Laserschutzbeauftragter (Dept. UMB)
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Kathrin Stückrath |
- Zytometrie
- Zellsortierung
- Image Analyse
- Extraktion von DNA, RNA und Proteinen
- PCR, qPCR
- Microarrays
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Christine Süring |
- Fermentation
- Zytometrie
- Image Analyse
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AG Microbial Data Science (Dr. Ulisses Nunes da Rocha)
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Sanchita Kamath
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Bearbeitung von Hochdurchsatz-Sequenzierdaten (HTS):
- Funktionale Beschreibung von HTS
- Genomrekonstruktion aus Metagenom-Datensätzen (Eukaryoten, Prokaryoten und Viren)
- Mikrobielle HTS-Simulation
IT-Expertise:
- Datenspeicherung und Life cycle-Management
- Installation und Entwicklung von Software, Tools und Pipelines für die (Multi-) Omics-Analyse
- Python, R, Bash und C++
- Maschinelles Lernen: Modelltraining
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AG Mikrobielle Interaktionsökologie (Prof. Dr. Antonis Chatzinotas)
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Anett Heidtmann |
- DNA-/RNA-Isolierung (Umweltproben, Kulturen)
- PCR (16S rRNA, funktionelle Gene, Plasmide) und T-RFLP
- Quantitative PCR
- Sequenzierung (inkl. Software) und ARB-Software (Stammbäume)
- Mikroskopie
- FISH und Hybridisierungen
- Phagen (Aufkonzentrierung, Molekularbiologie)
- Ausbildung von BiologielaborantInnen am UFZ
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Nicole Steinbach
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- DNA-/RNA-Isolierung (Umweltproben, Kulturen)
- PCR (16S rRNA, funktionelle Gene, Plasmide) und T-RFLP
- Sequenzierung (inkl. Software)
- Anreicherung/Kultivierung von Bakterien
- Viren/Phagen (Aufkonzentrierung, Molekularbiologie)
- Stable Isotope Probing (SIP)
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Lara Zenker (Auszubildende) |
- DNA/Plasmid-Isolationen
- Kultivierung von Mikroorganismen
- Ligation und Klonierung von PCR-Fragmenten
- PCR, qPCR
- Sanger Sequenzierung
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AG Pflanzen-Biogeochemie (Ass.-Prof. Dr. Marie Muehe)
Paul-Georg Richter
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- Geochemische Charakterisierung von Böden
- Probennahmekampagnen im Feld
- Mikrowellenaufschlüsse von Umweltproben
- planare Optodenvisualisierung von Sauerstoff, pH und Kohlenstoffdioxid
- Nukleinsäureextraktionen
- PCR, qPCR, cDNA Synthese
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AG Umweltmykologie (Dr. Dietmar Schlosser)
Madlen Schubert
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- Kryokonservierung von Mikroorganismen
- Ultra Performance Liquid Chromatography (UPLC)
- Enzymassays (Mikrotiterplatten-Reader)
- FTIR-spektroskopische Messungen
- Kultivierung von Pilzen
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Spül- und Nährbodenstation
Mandy Becker
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- Mikrobiologische Entsorgung
- Heißluftsterilisation
- Reinigung von Laborglas
- Autoklavieren
- Aerobe und anaerobe Nährmedien
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Katrin Lübke |
- Aerobe und anaerobe Nährmedien und Lösungen
- Heißluftsterilisation
- Autoklavieren
- Mikrobiologische Entsorgung
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