Kompetenzprofile der Technischen Mitarbeiter:innen

AG Angewandte Biokatalyse   (Prof. Dr. Bruno Bühler)

Daniel Spindler
  • Photoautotrophe und heterotrophe Kultivierungen (Bakterien, Pilze, Hefen)
  • Fermentation im benchtop- bis Technikums-Maßstab
  • Instandhaltung von Kultivierungstechnik
  • Filtrationsverfahren zur Aufreinigung von Enzymen
  • Prozessanalytik (enzymatische Aktivitätsassays, SDS-Page, YSI, Mikroskopie)
Dr. Jörg Toepel
  • PAM-Fluorometrie
  • Protein-/DNA-Analyse
  • Analytik
  • Molekularbiologie
  • Bioreaktoren

AG Antibiotikaresistenzen in der Umwelt   (Dr. Anja Worrich)

Maja Hinkel
  • Isolation, Anreicherung, Kultivierung und Quantifizierung aerober und anaerober Bakterien
  • Extraktion von DNA, RNA und Proteinen
  • PCR, qPCR, epicPCR
  • Fluoreszenz- und Lichtmikroskopie
  • FISH

AG Bioverfügbarkeit   (Dr. Lukas Wick)

Jana Reichenbach
  • Isolation, Anreicherung, Kultivierung und Quantifizierung aerober Mikroorganismen (Pilze und Bakterien)
  • Hochdurchsatz-Quantifizierung von Bakterien mittels Spiralplattierung und automatischer Kolonieauszählung
  • Bestimmung der Oberflächenhydrophobizität mikrobieller Oberflächen (Kontaktwinkelmessungen)
  • Bestimmung der Oberflächenspannung von Lösungen
  • Bestimmung des Schwimmverhaltens von Bakterien (Chemotaxie, Schwimm- und Schwärmverhalten)
Birgit Würz
  • Isolation, Anreicherung, Kultivierung und Quantifizierung aerober Mikroorganismen (Pilze und Bakterien)
  • Chemische Analytik organischer Stoffe: GC-FID, GC-ECD, GC-MS, Headspace
  • Extraktion und Analyse organischer Spurenstoffe
  • Bestimmung der Partikelgröße, Partikelkonzentration und der phys.-chem. Oberflächeneigenschaften (Isoelektischer Punkt, Zeta-Potenzial) von Bio-Kolloiden und Makromolekülen (Zeta-Sizer ULTRA)
  • Webseiten-Design und -Pflege

AG Elektrobiotechnologie   (Prof. Dr. Falk Harnisch)

Cornelia Dilßner
  • Aerobe und anaerobe Anreicherung/Isolierung von Mikroorganismen
  • Schadstoffabbau (Kinetik und Stöchiometrie)
  • Fermenterkulturen incl. diverser Kultivierungsregime
  • HPLC-Technik (Messung sowie Gerätebetreuung Shimadzu)
  • Enzymmessung (photometrisch, respiratorisch)
  • Zellaufschluss-Methoden
  • Abwasseranalytik
Philip Haus
  • Aerobe und anaerobe Kultivierung von Rein- und Mischkulturen
  • HPLC-Analytik
  • DNA-Extraktion, PCR- und T-RFLP-Fingerprinting
Anne Kuchenbuch
  • Aerobe und anaerobe Kultivierung von Mikroorganismen
  • HPLC-Analytik
  • DNA-Extraktion
  • PCR- und T-RFLP-Fingerprinting
  • Klonierung und Sequenzierung
  • Bioelektrochemische Methoden
  • Bioelektrochemische Fermentation
  • Fluoreszenz- und Lichtmikroskopie
Angelika Wichmann
  • GC-MS
  • Fettsäureanalytik
  • Chemostat-Bakterienkultivierung
  • VOC-Analytik
  • Metabolitenanalytik

AG Flow Cytometrie   (Prof. Dr. Susann Müller)

Florian Schattenberg
  • Zytometrie
  • Zellsortierung
  • DNA-Extraktion, PCR- und T-RFLP- Fingerprinting
  • Laserschutzbeauftragter (Dept. UMB)
Kathrin Stückrath
  • Zytometrie
  • Zellsortierung
  • Image Analyse
  • Extraktion von DNA, RNA und Proteinen
  • PCR, qPCR
  • Microarrays
Christine Süring
  • Fermentation
  • Zytometrie
  • Image Analyse

AG Katalytische Biofilme   (Prof. Dr. Katja Bühler)

Sebastian Röther

AG Microbial Data Science   (Dr. Ulisses Nunes da Rocha)

Sanchita Kamath

 Bearbeitung von Hochdurchsatz-Sequenzierdaten (HTS):
  • Funktionale Beschreibung von HTS
  • Genomrekonstruktion aus Metagenom-Datensätzen (Eukaryoten, Prokaryoten und Viren)
  • Mikrobielle HTS-Simulation
IT-Expertise:
  • Datenspeicherung und Life cycle-Management
  • Installation und Entwicklung von Software, Tools und Pipelines für die (Multi-) Omics-Analyse
  • Python, R, Bash und C++
  • Maschinelles Lernen: Modelltraining

AG Mikrobielle Interaktionsökologie   (Prof. Dr. Antonis Chatzinotas)

Anett Heidtmann
  • DNA-/RNA-Isolierung (Umweltproben, Kulturen)
  • PCR (16S rRNA, funktionelle Gene, Plasmide) und T-RFLP
  • Quantitative PCR
  • Sequenzierung (inkl. Software) und ARB-Software (Stammbäume)
  • Mikroskopie
  • FISH und Hybridisierungen
  • Phagen (Aufkonzentrierung, Molekularbiologie)
  • Ausbildung von BiologielaborantInnen am UFZ
Nicole Steinbach
  • DNA-/RNA-Isolierung (Umweltproben, Kulturen)
  • PCR (16S rRNA, funktionelle Gene, Plasmide) und T-RFLP
  • Sequenzierung (inkl. Software)
  • Anreicherung/Kultivierung von Bakterien
  • Viren/Phagen (Aufkonzentrierung, Molekularbiologie)
  • Stable Isotope Probing (SIP)
Lara Zenker (Auszubildende)
  • DNA/Plasmid-Isolationen
  • Kultivierung von Mikroorganismen
  • Ligation und Klonierung von PCR-Fragmenten
  • PCR, qPCR
  • Sanger Sequenzierung

AG Mikrobiologie anaerober Systeme   (Dr. Sabine Kleinsteuber)

Claudia Heber
  • Aerobe und anaerobe Kultivierung von Mikroorganismen
  • HPLC-Analytik (Messung und Gerätebetreuung Shimadzu)
  • Gas-Analytik (Druck, Headspace GC) und Einstellen von Gasmischungen
  • Herstellung anaerober Medien und Anaerob-Kultivierung (Hungate-Technik)
  • Betrieb anaerober Bioreaktoren
  • Fluoreszenz- und Lichtmikroskopie
Ute Lohse
  • Aerobe Kultivierung von Mikroorganismen
  • Extraktion von Nukleinsäuren und Proteinen aus Kulturen, Reaktor- und Umweltproben
  • PCR, qPCR, cDNA-Synthese
  • T-RFLP-Fingerprinting (inkl. Genemapper-Auswertung)
  • Klonierung
  • Sanger-Sequenzierung (inkl. Sequencher-Auswertung)
  • Illumina MiSeq Amplikon-Sequenzierung

AG Ökothermodynamik / Biokalorimetrie   (PD Dr. Thomas Maskow)

Hans Fritsche
  • Photokalorimetrie
  • HPLC-Analytik
  • Hochauflösende Respirometrie
  • Stammhaltung und -kultivierung
  • Isotherme Titrationskalorimetrie
Anika Krämer
  • Reaktionskalorimetrie
  • Isotherme Mikrokalorimetrie
Sven Paufler
  • Entwicklung von Hard- und Software zur Datenaquisition
  • Mikro- und Reaktionskalorimetrie
  • Fermentationen
  • Verbrennungskalorimetrie
Hannah Riede
(BA-Studentin)
  • Isotherme Mikrokalorimetrie
  • Isotherme Titrationskalorimetrie
  • HPLC Analytik

AG Pflanzen-Biogeochemie   (Ass.-Prof. Dr. Marie Muehe)

Paul-Georg Richter
  • Geochemische Charakterisierung von Böden     
  • Probennahmekampagnen im Feld    
  • Mikrowellenaufschlüsse von Umweltproben    
  • planare Optodenvisualisierung von Sauerstoff, pH und Kohlenstoffdioxid
  • Nukleinsäureextraktionen
  • PCR, qPCR, cDNA Synthese

AG System-Biotechnologie   (Dr. Jens Krömer)

Laurine Morgenstern
 

AG Umweltmykologie   (Dr. Dietmar Schlosser)

Madlen Schubert
  • Kryokonservierung von Mikroorganismen
  • Ultra Performance Liquid Chromatography (UPLC)
  • Enzymassays (Mikrotiterplatten-Reader)
  • FTIR-spektroskopische Messungen
  • Kultivierung von Pilzen

Spül- und Nährbodenstation   (Martina Kolbe)

Mandy Becker
  • Mikrobiologische Entsorgung
  • Heißluftsterilisation
  • Reinigung von Laborglas
  • Autoklavieren
  • Aerobe und anaerobe Nährmedien
Elke Häusler  
Martina Kolbe
  • Aerobe und anaerobe Nährmedien
  • Autoklavieren spezieller Laborgeräte und Lösungen
  • Spezifische Sterilisations- und Desinfektionmethoden
  • Mikrobiologischen Entsorgung, Sterilisation und Desinfektion
  • Fragen zu Nährmedien
Katrin Lübke
  • Aerobe und anaerobe Nährmedien und Lösungen
  • Heißluftsterilisation
  • Autoklavieren
  • Mikrobiologische Entsorgung