Dr. Christin Koch

Kontakt

Dr. Christin Koch
Wissenschaftlerin

Department Umweltmikrobiologie
Arbeitsgruppe Mikrobielle Bioelektrokatalyse und Bioelektrotechnologie
Helmholtz-Zentrum
für Umweltforschung - UFZ
Permoserstr. 15, 04318 Leipzig

Tel.: +49 341 235-1363
christin.koch@ufz.de

Christin Koch

Lebenslauf / Akademische Ausbildung

11/2015-01/2016

Gastwissenschaftlerin am Singapore Centre on Environmental Life Sciences Engineering (SCELSE) der Nanyang Technological University in Singapore (DAAD Stipendium)

Seit 2013

PostDoc am Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung – UFZ, Department Umweltmikrobiologie, Arbeitsgruppe Mikrobielle Bioelektrokatalyse & Bioelektrotechnologie

2010 bis 2012

Doktorandin am Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung – UFZ, Department Bioenergie
Promotion an der Universität Leipzig zum Thema Monitoring microbial community dynamics with flow cytometry (summa cum laude)

2009

M. Sc. in Biologie, Universität Leipzig
Masterarbeit an der Midsweden University, Sundsvall: Testing the limitations of a T-RFLP based method in the detection of basidiomycete species in artificial mixtures and construction of a corresponding library

2007

B. Sc. in Biological Sciences, Universität Konstanz
Bachelorarbeit: Agrobacterium tumefaciens vermittelte Transformation von Uromyces fabae


Forschungsinteresse

Die Leistungen von komplexen mikrobiellen Gemeinschaften sind sowohl für zahlreiche geochemische Prozesse als auch für industriell genutzte Systeme von großer Bedeutung, da sie auf die Funktionen der mikrobiellen Aktivität angewiesen sind. Diese natürlichen mikrobiellen Gemeinschaften, ihre Dynamiken und die Bedeutung ihrer Komplexität für Ökosystemfunktionen sind nur in Ansätzen verstanden. Als Umweltmikrobiologin interessiere ich mich für die Faktoren, die diese mikrobieleln Gemeinschaften formen und ihre Funktion bestimmen. Dafür wende ich eine Kombination aus molekularbiologischen und einzelzellbasierten optischen Methoden an.


Veröffentlichungen

2017

Kretzschmar, J., Koch, C., Liebetrau, J., Mertig, M., Harnisch, F., Electroactive biofilms as sensor for volatile fatty acids: Cross sensitivity, response dynamics, latency and stability, Sens Actuators B Chem 241, 466–472. http://dx.doi.org/10.1016/j.snb.2016.10.097

Gimkiewicz, C., Hegner, R., Gutensohn, M. F., Koch, C., Harnisch, F., Study of electrochemical CO2 reduction for future use in secondary microbial electrochemical technologies, ChemSusChem, doi: 10.1002/cssc.201601675 

2016

Koch, C., Harnisch, F., Is there a Specific Ecological Niche for Electroactive Microorganisms?, 2016, ChemElectroChem 3, 1282-1295. doi:10.1002/celc.201600079

Koch, C., Harnisch, F., What is the essence of microbial electroactivity? Front. Microbiol. 7, 1890. doi: 10.3389/fmicb.2016.01890

Koch, C., Aulenta, F., Schröder, U., Harnisch, F., Microbial electrochemical technologies: Industrial and environmental biotechnologies based on interactions of microorganisms with electrodes. Reference Module in Earth Systems and Environmental Sciences. Elsevier, Amsterdam, p. 1 - 19. doi:10.1016/B978-0-12-409548-9.09699-8

2015

Koch, C., Kuchenbuch, A., Kretschmar, J., Wedwitschka, H., Liebetrau, J., Müller, S., Harnisch, F., Coupling electric energy and biogas production in anaerobic digesters - impacts on the microbiome, 2015, RSC Adv. 5, 31329-31340. doi: 10.1039/c5ra03496e

Pous, N., Koch, C., Vilà-Rovira, A., Balaguer, M. D., Colprim, J.,  Mühlenberg, J.,  Müller, S., Harnisch, F., Puig, S., Monitoring and engineering reactor microbiomes of denitrifying bioelectrochemical systems, 2015, RSC Adv. 5, 68326-68333. doi: 10.1039/c5ra12113b

2014

Pous, N., Koch, C., Colprim, J., Puig, S., Harnisch, F., Extracellular electron transfer of biocathodes: revealing the potentials for nitrate and nitrite reduction of denitrifying microbiomes dominated by Thiobacillus sp., 2014, Electrochem. Commun. 49 , 93 - 97. doi:10.1016/j.elecom.2014.10.011

Koch, C., Popiel, P., Harnisch, F., Functional redundancy of microbial anodes fed by
domestic wastewater, 2014, ChemElectroChem 1, 1923-1931. doi: 10.1002/celc.201402216

Koch, C., Harnisch, F., Schröder, U., Müller, S., Cytometric fingerprints: evaluation of new tools for analyzing microbial community dynamics, 2014, Front. Microbiol., 5:273. doi: 10.3389/fmicb.2014.00273

Koch, C., Harms, H., Müller, S., Dynamics in the microbial cytome - single cell analytics in natural systems, 2014, Curr. Opin. Biotechnol. 27, 134-141. doi: 10.1016/j.copbio.2014.01.011

Koch, C., Müller, S., Harms, H., Harnisch, F., Microbiomes in bioenergy production: From analysis to management, 2014, Curr. Opin. Biotechnol. 27, 65-72. http://dx.doi.org/10.1016/j.copbio.2013.11.006

Schumann, J., Koch, C., Günther, S., Fetzer, I., Müller, S., flowCyBar: Analyze flow cytometric data using gate information, R package version 1.2.0, 2014. http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/flowCyBar.html

Schumann, J., Koch, C., Fetzer, I., Müller, S. flowCHIC: Analyze flow cytometric data using histogram information. R package version 1.0.0, 2014. http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/flowCHIC.html

2013

Koch, C., Günther, S., Desta, A.F., Hübschmann, T., Müller, S., Cytometric fingerprinting for analyzing microbial intra-community structure variation and identifying sub-community function, 2013, Nat. Protoc. 8 (1), 190-202. doi:10.1038/nprot.2012.149

Koch, C., Fetzer, I., Schmidt, T., Harms, H., Müller, S., Monitoring functions in managed microbial systems by cytometric bar coding, 2013, Environ. Sci. Technol. 47, 1753-1760. doi: 10.1021/es3041048

Koch, C., Fetzer, I., T., Harms, H., Müller, S., CHIC – an automated approach for the detection of dynamic variations in complex microbial communities, 2013, Cytometry A 83, 561-567. doi: 10.1002/cyto.a.22286

Koch, C., Brumme, B., Müller, S., Mikrobielle Gemeinschaften im Visier der Durchflusszytometrie, 2013, BIOspektrum 19, 396-400. doi: 10.1007/s12268-013-0329-6

2012

Günther, S., Koch, C., Hübschmann, T., Röske, I., Müller, R.A., Bley, T., Harms, H., Müller, S., Correlation of community dynamics and process parameters as a tool for the prediction of the stability of wastewater treatment, 2012, Environ. Sci. Technol. 46, 84-92. doi: 10.1021/es2010682

2011

Harnisch, F., Koch, C., Patil, S.A., Hübschmann, T., Müller, S., Schröder, U., Revealing the electrochemically driven selection in natural community derived microbial biofilms using flow-cytometry, 2011, Energy Environ. Sci., 4 (4), 1265-1267. doi: 10.1039/C0EE00605J

Patil, S.A., Harnisch, F., Koch, C., Hübschmann, T., Fetzer, I., Carmona-Martínez, A.A., Müller, S., Schröder, U., Electroactive mixed culture derived biofilms in microbial bioelectrochemical systems: the role of pH on biofilm formation, performance and composition, 2011, Bioresour. Technol. 102 (20), 9683 – 9690. doi: 10.1016/j.biortech.2011.07.087

Djulic, A., Schmid, A., Lenz, H., Sharma, P., Koch, C., Wirsel, S.G.R., Voegele, R.T., Transient transformation of the obligate biotrophic rust fungus Uromyces fabae using biolistics, 2011, Fungal Biology 115 (7), 633-642. doi: 10.1016/j.funbio.2011.03.007

2010

Koch, C., Brumme, B., Schmidt, M., Flieger, K., Schnetter, R., Wilhelm, C., The life cycle of the amoeboid alga Synchroma grande (Synchromophyceae, Heterokontophyta) - highly adapted yet equally equipped for rapid diversification in benthic habitats, 2010, Plant Biology 13 (5): 801-808. doi: 10.1111/j.1438-8677.2010.00427.x