Dominique Türkowsky

Kontakt

Dominique Türkowsky
Doktorandin

Department Molekulare Systembiologie
Helmholtz-Zentrum
für Umweltforschung - UFZ
Permoserstr. 15
04318 Leipzig

Tel: 0341 235 1352
Fax: 0341 235 45 1352
Dominique.Tuerkowsky@ufz.de


Lebenslauf

2014 - heute

Doktorarbeit
Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung, Leipzig
Regulation of expression and activity of dehalogenating enzymes in Dehalococcoides mccartyi strain CBDB1

2013 - 2014

Forschungsprojekt
Research Institute of Genetic and Molecular Biology Engineering (INGEBI-CONICET), Buenos Aires, Argentinien
Identification of Bacterial indicators of agricultural management, based on quantitative PCR, pyrosequencing of 16S rDNA and abiotic data

2011 - 2012

Masterarbeit
Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung, Leipzig
Characterization of the heterogeneity of Pseudomonas cultures using flow cytometry and quantitative Real Time PCR

2007 - 2012

Studium Biologie
Universität Leipzig
Schwerpunkt Umweltmikrobiologie und Biotechnologie


Forschungsschwerpunkte

Im Rahmen meiner Doktorarbeit untersuche ich den Abbau toxischer Substanzen im Boden durch Bakterien. Jahrzehntelang wurden halogenierte organische Verbindungen in industriellen Anwendungen, z.B. als Lösungsmittel verwendet. Riesige Mengen gelangten in die Umwelt und kontaminierten Wasserreservoirs weltweit. Eine Reihe anaerober Bakterien kann diese Substanzen entgiften und dabei Energie gewinnen.

Diese reduktive Dehalogenierung ist Gegenstand der DFG-Forschergruppe FOR 1530. In diesem Rahmen konzentriere ich mich auf die genaue Regulation dieses Abbauprozesses in den Modellorganismen Dehalococcoides maccartyi CBDB1 und Sulfurospirillum spp. Hierfür quantifiziere ich die beteiligten Enzyme und analysiere deren Interaktionen sowie posttranslationalen Modifikationen. Dabei kommt eine Kombination von affinitätsbasierter Anreicherung und Massenspektrometrie zur Anwendung.

Publikationsliste

2018 (3)

  • Türkowsky, D., Esken, J., Goris, T., Schubert, T., Diekert, G., Jehmlich, N., von Bergen, M., (2018):
    A retentive memory of tetrachloroethene respiration in Sulfurospirillum halorespirans - involved proteins and a possible link to acetylation of a two-component regulatory system
    J. Proteomics 181 , 36 - 46
    Volltext (URL)
  • Türkowsky, D., Jehmlich, N., Diekert, G., Adrian, L., von Bergen, M., Goris, T., (2018):
    An integrative overview of genomic, transcriptomic and proteomic analyses in organohalide respiration research
    FEMS Microbiol. Ecol. 94 (3), fiy013
    Volltext (URL)
  • Türkowsky, D., Lohmann, P., Mühlenbrink, M., Schubert, T., Adrian, L., Goris, T., Jehmlich, N., von Bergen, M., (2018):
    Thermal proteome profiling allows quantitative assessment of interactions between tetrachloroethene reductive dehalogenase and trichloroethene
    J. Proteomics
    Volltext (URL)

2017 (1)

  • Hartwig, S., Dragomirova, N., Kublik, A., Türkowsky, D., von Bergen, M., Lechner, U., Adrian, L., Sawers, R.G., (2017):
    A H2-oxidizing, 1,2,3-trichlorobenzene-reducing multienzyme complex isolated from the obligately organohalide-respiring bacterium Dehalococcoides mccartyi strain CBDB1
    Environ. Microbiol. Rep. 9 (5), 618 - 625
    Volltext (URL)
    Daten DOI

2015 (1)

  • Hartwig, S., Thomas, C., Krumova, N., Quitzke, V., Türkowsky, D., Jehmlich, N., Adrian, L., Sawers, R.G., (2015):
    Heterologous complementation studies in Escherichia coli with the Hyp accessory protein machinery from Chloroflexi provide insight into [NiFe]-hydrogenase large subunit recognition by the HypC protein family
    Microbiology-(UK) 161 (11), 2204 - 2219
    Volltext (URL)
    Daten DOI

2014 (2)

  • Jahn, M., Vorpahl, C., Türkowsky, D., Lindmeyer, M., Bühler, B., Harms, H., Müller, S., (2014):
    Accurate determination of plasmid copy number of flow-sorted cells using droplet digital PCR
    Anal. Chem. 86 (12), 5969 - 5976
    Volltext (URL)
  • Jahn, M., Vorpahl, C., Türkowsky, D., Lindmeyer, M., Bühler, B., Harms, H., Müller, S., (2014):
    Population heterogeneity in Pseudomonas putida analyzed on the single cell level using proteomics and digital PCR
    New Biotech. 31 (Suppl.), S58 - S59
    Volltext (URL)
  • Figuerola, E.L.M., Guerrero, L.D., Türkowsky, D., Wall, L.G., and Erijman, L. (2014):
    Crop monoculture rather than agriculture reduces the turnover of soil bacterial communities at a regional scale
    Environmental Microbiology 17 (3), 678-88
    full text (pdf)