Dr. Johannes Schmidt
Postdoc in der Functional Genomics Gruppe
Kontakt
Helmholtz-Zentrum
für Umweltforschung - UFZ
Permoserstr. 15
04318 Leipzig, Germany
Tel: 0341 235 1354
johannes.schmidt@ufz.de
Forschungsschwerpunkte
- Funktionelle proteomische Analysen im Aktivierungsverlauf von Immunzellen
- Integrative Transcriptomics und Proteomics zur Identifizierung von bisher unbekannten Proteinen
- Weiterentwicklung von analytischen Methoden zur Untersuchung von posttranslationalen Modifikationen (PTM)
- Nutzung verschiedener nanoLC-MS Systeme (z.B. Q Exactive HF, Triple Quad 5500)
Lebenslauf
Seit 01-2017
Wissenschaftlicher Mitarbeiter/Postdoc im Department für Molekulare Systembiologie (MOLSYB) am Helmholtz-Zentrum, für Umweltforschung
10-2013 - 12-2016
Doktorand im Department für Molekulare Systembiologie (ehemals Department für Proteomik) am Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung
09-2013
Wissenschaftliche Hilfskraft im Department für Proteomik am Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung – UFZ, Leipzig
10-2011 – 09-2013
Masterstudium im Studiengang „Mikrobiologie und Biochemie“ an der Universität Rostock
„Methoden zur Gewinnung von Proteinextrakten aus Muskelgewebe für die 2D-Gel bzw. LC-MS-basierte Proteomanalyse“ am Proteom Zentrum Rostock
08-2011
Teilnahme und Präsentation der Bachelorarbeit in der „5th European Summer School – Proteomics Basics“ in Brixen, Italien
10-2008 – 09-2011
Bachelorstudium im Studiengang „Biowissenschaften“ an der Universität Rostock
„Entwicklung proteinanalytischer Methoden zur Titerbestimmung therapeutischer Antikörper am Beispiel von Rituximab“ am Proteom Zentrum Rostock
07-2007
Abitur am John-Brinckman-Gymnasium in Güstrow
Publikationen
2018 (2)
- Schmidt, J.R., Rücker-Braun, E., Heidrich, K., von Bonin, M., Stölzel, F., Thiede, C., Middeke, J.M., Ehninger, G., Bornhäuser, M., Schetelig, J., Schubert, K., von Bergen, M., Heidenreich, F., (2018):
Pilot study on mass spectrometry–based analysis of the proteome of CD34+CD123+ progenitor cells for the identification of potential targets for immunotherapy in acute myeloid leukemia
Proteomes 6 (1), art. 11
Volltext (URL) - Thabet, A., Schmidt, J., Baumann, S., Honscha, W., von Bergen, M., Daugschies, A., Bangoura, B., (2018):
Resistance towards monensin is proposed to be acquired in a Toxoplasma gondii model by reduced invasion and egress activities, in addition to increased intracellular replication
Parasitology 145 (3), 313 - 325
Volltext (URL)
2016 (2)
- Förster, Y., Schmidt, J.R., Wissenbach, D.K., Pfeiffer, S.E.M., Baumann, S., Hofbauer, L.C., von Bergen, M., Kalkhof, S., Rammelt, S., (2016):
Microdialysis sampling from wound fluids enables quantitative assessment of cytokines, proteins, and metabolites reveals bone defect-specific molecular profiles
PLOS One 11 (7), e0159580
Volltext (URL) - Schmidt, J.R., Kliemt, S., Preissler, C., Moeller, S., von Bergen, M., Hempel, U., Kalkhof, S., (2016):
Osteoblast-released matrix vesicles, regulation of activity and composition by sulfated and non-sulfated glycosaminoglycans
Mol. Cell. Proteomics 15 , 558 - 572
Volltext (URL)
2014 (1)
- Kalkhof, S., Förster, Y., Schmidt, J., Schulz, M.C., Baumann, S., Weißflog, A., Gao, W., Hempel, U., Eckelt, U., Rammelt, S., von Bergen, M., (2014):
Proteomics and metabolomics for in situ monitoring of wound healing
Biomed Res. Int. 2014 , art. 934848
Volltext (URL)