Department Proteomik

Department Proteomik, Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung - UFZ

Departmentleiter:
Prof. Dr. Martin von Bergen
Sekretariat:
Christine Becher

Tel.: (0341) 235-1264
Fax: (0341) 235-1786

Permoserstraße 15
04318 Leipzig

Die Träger der biologischen Aktivität in unseren und in den Zellen aller anderen Lebewesen sind die Proteine. Die Gesamtheit der Proteine einer Zelle wird als Proteom bezeichnet. Es wird von den Zellen in Abhängigkeit von den Lebensumständen und dem Zweck der Zellen entsprechend der in der DNA gespeicherten Information gebildet und gegebenenfalls noch weiter verändert. Da Proteine an allen Prozessen beteiligt sind, bieten sie einen guten Ansatzpunkt, biologische Vorgänge, aber auch Krankheiten besser zu verstehen. Außerdem können sie auch als Indikatoren für die Diagnostik von Krankheiten eingesetzt werden, da sich kranke Zellen oftmals deutlich in ihrem Proteinmuster von gesunden Zellen unterscheiden.

Ziel der Proteomforschung am UFZ ist es vor allem zu untersuchen, welche Rolle Proteine in der Entstehung von umweltbedingten Krankheiten wie Allergien und anderen durch Umweltfaktoren ausgelösten krankhaften Veränderungen - beispielsweise des Immunsystems - spielen.

Dafür werden die in Modellsystemen oder auch von Patienten gewonnenen Proben auf Veränderungen im Proteom, also der Häufigkeit einzelner Proteine und ihrer Eigenschaften untersucht. So können Krankheitsursachen und deren Verlauf besser verstanden werden.

Auch in der Mikrobiologie ist die Analyse des Proteoms ein wichtiger Ansatz zum vertieften Verständnis von mikrobiologisch beeinflussten Prozessen in der Umwelt. Das betrifft sowohl die natürlichen Stoffkreisläufe als auch den bakteriellen Abbau von Umweltschadstoffen. Eine besondere Bedeutung spielen hierbei die komplexen Wechselwirkungen innerhalb von mikrobiellen Gemeinschaften.

Ziel der Forschungsarbeiten ist also ein vertieftes molekulares Verständnis für biologische Prozesse in umweltbedingten Krankheiten und in der Umwelt.

Neue Software und Techniken

Die neue Software ProteIn Protein INteraction Optimizer - PIPINO

(Kooperation mit Prof. Labudde, Bioinformatics Group Mittweida) ist online

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aktuelle Publikationen

2014 (17)

  • Bastida, F., Jehmlich, N., Ondoño, S., von Bergen, M., García, C., Moreno, J.L. (2014):
    Characterization of the microbial community in biological soil crusts dominated by Fulgensia desertorum (Tomin) Poelt and Squamarina cartilaginea (With.) P. James and in the underlying soil
    Soil Biol. Biochem. 76 , 70 - 79
    Volltext (URL)
  • Bozinovski, D., Taubert, M., Kleinsteuber, S., Richnow, H.-H., von Bergen, M., Vogt, C., Seifert, J. (2014):
    Metaproteogenomic analysis of a sulfate-reducing enrichment culture reveals genomic organization of key enzymes in the m-xylene degradation pathway and metabolic activity of proteobacteria
    Syst. Appl. Microbiol. 37 (7), 488 - 501
    Volltext (URL)
  • Franck, U., Weller, A., Röder, S., Herberth, G., Junge, K.M., Kohajda, T., von Bergen, M., Rolle-Kampczyk, U., Diez, U., Borte, M., Lehmann, I. (2014):
    Prenatal VOC exposure and redecoration are related to wheezing in early infancy
    Environ. Int. 73 , 393 - 401
    Volltext (URL)
  • Herberth, G., Bauer, M., Gasch, M., Hinz, D., Röder, S., Olek, S., Kohajda, T., Rolle-Kampczyk, U., von Bergen, M., Sack, U., Borte, M., Lehmann, I. (2014):
    Maternal and cord blood miR-223 expression associates with prenatal tobacco smoke exposure and low regulatory T-cell numbers
    J. Allergy Clin. Immunol. 133 (2), 543 - 550.e4
    Volltext (URL)
  • Imhasly, S., Naegeli, H., Baumann, S., von Bergen, M., Luch, A., Jungnickel, H., Potratz, S., Gerspach, C. (2014):
    Metabolomic biomarkers correlating with hepatic lipidosis in dairy cows
    BMC Vet. Res. 10 , art. 122
    Volltext (PDF)
  • Jungandreas, A., Schellenberger Costa, B., Jakob, T., von Bergen, M., Baumann, S., Wilhelm, C. (2014):
    The acclimation of Phaeodactylum tricornutum to blue and red light does not influence the photosynthetic light reaction but strongly disturbs the carbon allocation pattern
    PLOS One 9 (8), e99727
    Volltext (PDF)
  • Junge, K.M., Hörnig, F., Herberth, G., Röder, S., Kohajda, T., Rolle-Kampczyk, U., von Bergen, M., Borte, M., Simon, J.-C., Heroux, D., Denburg, J.A., Lehmann, I. (2014):
    The LINA cohort: cord blood eosinophil/basophil progenitors predict respiratory outcomes in early infancy
    Clin. Immunol. 152 (1-2), 68 - 76
    Volltext (URL)
  • Jungnickel, H., Luch, A., Potratz, S., von Bergen, M., Baumann, S., Tarnow, P. (2014):
    Identification of lipidomic biomarkers for coexposure to subtoxic doses of benzo[a]pyrene and cadmium: the toxicological cascade biomarker approach
    Environ. Sci. Technol. 48 (17), 10423 - 10431
    Volltext (URL)
  • Kalkhof, S., Förster, Y., Schmidt, J., Schulz, M.C., Baumann, S., Weißflog, A., Gao, W., Hempel, U., Eckelt, U., Rammelt, S., von Bergen, M. (2014):
    Proteomics and metabolomics for in situ monitoring of wound healing
    Biomed Res. Int. 2014 , art. 934848
    Volltext (PDF)
  • Kleindienst, S., Herbst, F.-A., Stagars, M., von Netzer, F., von Bergen, M., Seifert, J., Peplies, J., Amann, R., Musat, F., Lueders, T., Knittel, K. (2014):
    Diverse sulfate-reducing bacteria of the Desulfosarcina/Desulfococcus clade are the key alkane degraders at marine seeps
    ISME J. 8 , 2029 - 2044
    Volltext (URL)
  • Marozava, S., Röling, W.F.M., Seifert, J., Küffner, R., von Bergen, M., Meckenstock, R.U. (2014):
    Physiology of Geobacter metallireducens under excess and limitation of electron donors. Part I. Batch cultivation with excess of carbon sources
    Syst. Appl. Microbiol. 37 (4), 277 - 286
    Volltext (PDF)
  • Marozava, S., Röling, W.F.M., Seifert, J., Küffner, R., von Bergen, M., Meckenstock, R.U. (2014):
    Physiology of Geobacter metallireducens under excess and limitation of electron donors. Part II. Mimicking environmental conditions during cultivation in retentostats
    Syst. Appl. Microbiol. 37 (4), 287 - 295
    Volltext (PDF)
  • Mussotter, F., Haase, A., Tomm, J.M., El Ali, Z., Kerdine-Römer, S., Pallardy, M., von Bergen, M., Luch, A. (2014):
    A proteomics approach to elucidate the role of Nrf2 in primary bone-marrow-derived dendritic cells of mice upon activation by contact allergens
    Toxicol. Lett. 229 (Suppl.), S203
    Volltext (URL)
  • Rösch, C., Kohajda, T., Röder, S., von Bergen, M., Schlink, U. (2014):
    Relationship between sources and patterns of VOCs in indoor air
    Atmos. Pollut. Res. 5 (1), 129 - 137
    Volltext (URL)
  • Schiffmann, C., Hansen, R., Baumann, S., Kublik, A., Nielsen, P.H., Adrian, L., von Bergen, M., Jehmlich, N., Seifert, J. (2014):
    Comparison of targeted peptide quantification assays for reductive dehalogenases by selective reaction monitoring (SRM) and precursor reaction monitoring (PRM)
    Anal. Bioanal. Chem. 406 (1), 283 - 291
    Volltext (URL)
  • Schiffmann, C.L., Jehmlich, N., Otto, W., Hansen, R., Nielsen, P.H., Adrian, L., Seifert, J., von Bergen-Tomm, M. (2014):
    Proteome profile and proteogenomics of the organohalide-respiring bacterium Dehalococcoides mccartyi strain CBDB1 grown on hexachlorobenzene as electron acceptor
    J. Proteomics 98 , 59 - 64
    Volltext (URL)
  • Uhlmann, K., Gibb, S., Kalkhof, S., Arroyo-Abad, U., Schulz, C., Hoffmann, B., Stubbins, F., Carpenter, S., Beer, M., von Bergen, M., Feltens, R. (2014):
    Species determination of Culicoides biting midges via peptide profiling using matrix-assisted laser desorption ionization mass spectrometry
    Parasites Vectors 7 , 392
    Volltext (PDF)

2013 (27)

  • Blumert, C., Kalkhof, S., Brocke-Heidrich, K., Kohajda, T., von Bergen, M., Horn, F. (2013):
    Analysis of the STAT3 interactome using in-situ biotinylation and SILAC
    J. Proteomics 94 , 370 - 386
    Volltext (URL)
  • Bodelier, P.L.E., Meima-Franke, M., Hordijk, C.A., Steenbergh, A.K., Hefting, M.E., Bodrossy, L., von Bergen, M., Seifert, J. (2013):
    Microbial minorities modulate methane consumption through niche partitioning
    ISME J. 7 , 2214 - 2228
    Volltext (URL)
  • Boll, K., Reiche, K., Kasack, K., Mörbt, N., Kretzschmar, A.K., Tomm, J.M., Verhaegh, G., Schalken, J., von Bergen, M., Horn, F., Hackermüller, J. (2013):
    MiR-130a, miR-203 and miR-205 jointly repress key oncogenic pathways and are downregulated in prostate carcinoma
    Oncogene 32 , 277 - 285
    Volltext (URL)
  • Eberlein, C., Estelmann, S., Seifert, J., von Bergen, M., Müller, M., Meckenstock, R.U., Boll, M. (2013):
    Identification and characterization of 2-naphthoyl-coenzyme A reductase, the prototype of a novel class of dearomatizing reductases
    Mol. Microbiol. 88 (5), 1032 - 1039
    Volltext (URL)
  • Ferrer, M., Ruiz, A., Lanza, F., Haange, S.-B., Oberbach, A., Till, H., Bargiela, R., Campoy, C., Segura, M.T., Richter, M., von Bergen, M., Seifert, J., Suarez, A. (2013):
    Microbiota from the distal guts of lean and obese adolescents exhibit partial functional redundancy besides clear differences in community structure
    Environ. Microbiol. 15 (1), 211 - 226
    Volltext (URL)
  • Guazzaroni, M.-E., Herbst, F.-A., Lores, I., Tamames, J., Peláez, A.I., López-Cortés, N., Alcaide, M., del Pozo, M.V., Vieites, J.M., von Bergen, M., Gallego, J.L.R., Bargiela, R., López-López, A., Pieper, D.H., Rosselló-Móra, R., Sánchez, J., Seifert, J., Ferrer, M. (2013):
    Metaproteogenomic insights beyond bacterial response to naphthalene exposure and bio-stimulation
    ISME J. 7 , 122 - 136
    Volltext (URL)
  • Herberth, G., Bauer, M., Gasch, M., Hinz, D., Röder, S., Olek, S., Kohajda, T., Rolle-Kampczyk, U., von Bergen-Tomm, M., Sack, U., Borte, M., Lehmann, I. (2013):
    Maternal and cord blood miR-223 expression associates with prenatal tobacco smoke exposure and with low Treg numbers
    Allergy 68 (Suppl. 97), 628 - 628
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  • Herbst, F.-A., Bahr, A., Duarte, M., Pieper, D.H., Richnow, H.-H., von Bergen, M., Seifert, J., Bombach, P. (2013):
    Elucidation of in situ polycyclic aromatic hydrocarbon degradation by functional metaproteomics (protein-SIP)
    Proteomics 13 (18-19), 2910 - 2920
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  • Herbst, F.-A., Taubert, M., Jehmlich, N., Behr, T., Schmidt, F., von Bergen, M., Seifert, J. (2013):
    Sulfur-34S stable isotope labeling of amino acids for quantification (SULAQ34) of proteomic changes in Pseudomonas fluorescens during naphthalene degradation
    Mol. Cell. Proteomics 12 (8), 2060 - 2069
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  • Jahn, M., Seifert, J., von Bergen, M., Schmid, A., Bühler, B., Müller, S. (2013):
    Subpopulation-proteomics in prokaryotic populations
    Curr. Opin. Biotechnol. 24 (1), 79 - 87
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  • Jechalke, S., Franchini, A., Bastida, F., Bombach, P., Rosell, M., Seifert, J., von Bergen, M., Vogt, C., Richnow, H.H. (2013):
    Analysis of structure, function, and activity of a benzene-degrading microbial community
    FEMS Microbiol.Ecol. 85 (1), 14 - 26
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  • Kliemt, S., Lange, C., Otto, W., Hintze, V., Möller, S., von Bergen, M., Hempel, U., Kalkhof, S. (2013):
    Sulfated hyaluronan containing collagen matrices enhance cell-matrix-interaction, endocytosis, and osteogenic differentiation of human mesenchymal stromal cells
    J. Proteome Res. 12 (1), 378 - 389
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  • Kung, J.W., Seifert, J., von Bergen, M., Boll, M. (2013):
    Cyclohexanecarboxyl-coenzyme A (CoA) and cyclohex-1-ene-1-carboxyl-CoA dehydrogenases, two enzymes involved in the fermentation of benzoate and crotonate in Syntrophus aciditrophicus
    J. Bacteriol. 195 (14), 3193 - 3200
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  • Leibeling, S., Maeß, M.B., Centler, F., Kleinsteuber, S., von Bergen, M., Thullner, M., Harms, H., Müller, R.H. (2013):
    Posttranslational oxidative modification of (R)-2-(2,4-dichlorophenoxy)propionate/α-ketoglutarate-dependent dioxygenases (RdpA) leads to improved degradation of 2,4-dichlorophenoxyacetate (2,4-D)
    Eng. Life Sci. 13 (3), 278 - 291
    Volltext (URL)
  • Markle, J.G.M., Frank, D.N., Mortin-Toth, S., Robertson, C.E., Feazel, L.M. , Rolle-Kampczyk, U., von Bergen, M., McCoy, C.D., Macpherson, A.J., Danska, J.S. (2013):
    Sex differences in the gut microbiome drive hormone-dependent regulation of autoimmunity
    Science 339 (6123 ), 1084 - 1088
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  • Müller, S.A., Findeiß, S., Pernitzsch, S.R., Wissenbach, D.K., Stadler, P.F., Hofacker, I.L., von Bergen, M., Kalkhof, S. (2013):
    Identification of new protein coding sequences and signal peptidase cleavage sites of Helicobacter pylori strain 26695 by proteogenomics
    J. Proteomics 86 , 27 - 42
    Volltext (URL)
  • Murugaiyan, J., Rockstroh, M., Wagner, J., Baumann, S., Schorsch, K., Trump, S., Lehmann, I., von Bergen, M., Tomm, J.M. (2013):
    Benzo[a]pyrene affects Jurkat T cells in the activated state via the antioxidant response element dependent Nrf2 pathway leading to decreased IL-2 secretion and redirecting glutamine metabolism
    Toxicol. Appl. Pharmacol. 269 (3), 307 - 316
    Volltext (URL)
  • Murugaiyan, J., Weise, C., von Bergen, M., Roesler, U. (2013):
    Two-dimensional proteome reference map of Prototheca zopfii revealed reduced metabolism and enhanced signal transduction as adaptation to an infectious life style
    Proteomics 13 (17), 2664 - 2669
    Volltext (URL)
  • Murugesan, K., Baumann, S., Wissenbach, D.K., Kliemt, S., Kalkhof, S., Otto, W., Mögel, I., Kohajda, T., von Bergen, M., Tomm, J.M. (2013):
    Subtoxic and toxic concentrations of benzene and toluene induce Nrf-2 mediated anti-oxidative stress response and affect the central carbon metabolism in lung epithelial cells A549
    Proteomics 13 (21), 3211 - 3221
    Volltext (URL)
  • Pérez-Cobas, A.E., Gosalbes, M.J., Friedrichs, A., Knecht, H., Artacho, A., Eismann, K., Otto, W., Rojo, D., Bargiela, R., von Bergen, M., Neulinger, S.C., Däumer, C., Heinsen, F.A., Latorre, A., Barbas, C., Seifert, J., Martins dos Santos, V., Ott, S.J., Ferrer, M., Moya, A. (2013):
    Gut microbiota disturbance during antibiotic therapy: a multi-omic approach
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  • Seifert, J., Herbst, F.-A., Nielsen, P.H., Planes, F.J., Ferrer, M., von Bergen, M. (2013):
    Bioinformatic progress and applications in metaproteogenomics for bridging the gap between genomic sequences and metabolic functions in microbial communities
    Proteomics 13 (18-19), 2786 - 2804
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    The nitrogen cycle in anaerobic methanotrophic mats of the Black Sea is linked to sulfate reduction and biomass decomposition
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  • Tomm, J.M., Krause, C., Simon, J.C., Treudler, R., von Bergen, M., Averbeck, M. (2013):
    Pyruvate kinase and phosphopyruvate hydratase as novel IgE reactive proteins in prawn
    J. Invest. Allergol. Clin. Immunol. 23 (6), 443 - 445
    Volltext (PDF)
  • Tomm, J.M., van Do, T., Jende, C., Simon, J.C., Treudler, R., von Bergen, M., Averbeck, M. (2013):
    Identification of new potential allergens from Nile perch (Lates niloticus) and Cod (Gadus morhua)
    J. Invest. Allergol. Clin. Immunol. 23 (3), 159 - 167
  • von Bergen, M., Jehmlich, N., Taubert, M., Vogt, C., Bastida, F., Herbst, F.-A., Schmidt, F., Richnow, H.-H., Seifert, J. (2013):
    Insights from quantitative metaproteomics and protein-stable isotope probing into microbial ecology
    ISME J. 7 (10), 1877 - 1885
    Volltext (URL)
  • Weisse, K., Winkler, S., Hirche, F., Herberth, G., Hinz, D., Bauer, M., Röder, S., Rolle-Kampczyk, U., von Bergen, M., Olek, S., Richter, T., Diez, U., Borte, M., Stangl, G.I., Lehmann, I. (2013):
    Maternal and newborn vitamin D status and its impact on food allergy development in the German LINA cohort study
    Allergy 68 (2), 220 - 228
    Volltext (URL)

2012 (25)

  • Baumgarten, T., Sperling, S., Seifert, J., von Bergen, M., Steiniger, F., Wick, L.Y., Heipieper, H.J. (2012):
    Membrane vesicle formation as multiple stress response mechanism enhances cell surface hydrophobicity and biofilm formation of Pseudomonas putida DOT-T1E
    Appl. Environ. Microb. 78 (17), 6217 - 6224
    Volltext (URL)
  • Bönisch, U., Böhme, A., Kohajda, T., Mögel, I., Schütze, N., von Bergen, M., Simon, J.C., Lehmann, I., Polte, T. (2012):
    Volatile organic compounds enhance allergic airway inflammation in an experimental mouse model
    PLoS One 7 (7), e39817
    Volltext (URL)
  • Bozinovski, D., Herrmann, S., Richnow, H.-H., von Bergen, M., Seifert, J., Vogt, C. (2012):
    Functional analysis of an anaerobic m-xylene-degrading enrichment culture using protein-based stable isotope probing
    FEMS Microbiol.Ecol. 81 (1), 134 - 144
    Volltext (URL)
  • Goettsch, C., Kliemt, S., Sinningen, K., von Bergen, M., Hofbauer, L.C., Kalkhof, S. (2012):
    Quantitative proteomics reveals novel functions of osteoclast-associated receptor in STAT signaling and cell adhesion in human endothelial cells
    J. Mol. Cell. Cardiol. 53 (6), 829 - 837
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  • Gündel, U., Kalkhof, S., Zitzkat, D.P., von Bergen, M., Altenburger, R., Küster, E. (2012):
    Concentration-response concept in ecotoxicoproteomics: effects of different phenanthrene concentrations to the zebrafish (Danio rerio) embryo proteome
    Ecotox. Environ. Safe. 76 (1), 11 - 22
    Volltext (URL)
  • Haange, S.-B., Oberbach, A., Schlichting, N., Hugenholtz, F., Smidt, H., von Bergen, M., Till, H., Seifert, J. (2012):
    Metaproteome analysis and molecular genetics of rat intestinal microbiota reveals section and localisation resolved species distribution and enzymatic functionalities
    J. Proteome Res. 11 (11), 5406 - 5417
    Volltext (URL)
  • Haas, S., Jahnke, H.-G., Moerbt, N., von Bergen, M., Aharinejad, S., Andrukhova, O., Robitzki, A.A. (2012):
    DIGE proteome analysis reveals suitability of ischemic cardiac in vitro model for studying cellular response to acute ischemia and regeneration
    PLoS One 7 (2), e31669
    Volltext (URL)
  • Hörnig, F., Weisse, K., Röder, S., Kohajda, T., von Bergen-Tomm, M., Borte, M., Diez, U., Simon, J., Denburg, J., Lehmann, I. (2012):
    Infantile eosinophil/basophil progenitors are more sensitive to indoor chemical exposures compared to their mothers
    Allergy 67 (Suppl. 96), 574 - 574
    Volltext (URL)
  • Jehmlich, N., Kopinke, F.-D., Lenhard, S., Vogt, C., Herbst, F.-A., Seifert, J., Lissner, U., Völker, U., Schmidt, F., von Bergen, M. (2012):
    Sulfur-36S stable isotope labeling of amino acids for quantification (SULAQ)
    Proteomics 12 (1), 37 - 42
    Volltext (URL)
  • Kespohl, S., Kotschy-Lang, N., Tomm, J.M., von Bergen, M., Maryska, S., Brüning, T., Raulf-Heimsoth, M. (2012):
    Occupational IgE-mediated softwood allergy: characterization of the causative allergen
    Int. Arch. Allergy Immunol. 157 (2), 202 - 208
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  • Marco-Urrea, E., Seifert, J., von Bergen, M., Adrian, L. (2012):
    Stable isotope peptide mass spectrometry to decipher amino acid metabolism in Dehalococcoides strain CBDB1
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  • Morris, B.E.L., Herbst, F.-A., Bastida, F., Seifert, J., von Bergen, M., Richnow, H.-H., Suflita, J.M. (2012):
    Microbial interactions during residual oil and n-fatty acid metabolism by a methanogenic consortium
    Environ. Microbiol. Rep. 4 (3), 297 - 306
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  • Müller, S.A., van der Smissen, A., von Feilitzsch, M., Anderegg, U., Kalkhof, S., von Bergen, M. (2012):
    Quantitative proteomics reveals altered expression of extracellular matrix related proteins of human primary dermal fibroblasts in response to sulfated hyaluronan and collagen applied as artificial extracellular matrix
    J. Mater. Sci.-Mater. Med. 23 (12), 3053 - 3065
    Volltext (URL)
  • Oberbach, A., von Bergen, M., Blueher, S., Lehmann, S., Till, H. (2012):
    Combined serum proteomic and metabonomic profiling after laparoscopic sleeve gastrectomy in children and adolescents
    J. Laparoendosc. Adv. Surg. Tech. 22 (2), 184 - 188
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  • Oberender, J., Kung, J.W., Seifert, J., von Bergen, M., Boll, M. (2012):
    Identification and characterization of a succinyl-coenzyme A (CoA):benzoate CoA transferase in Geobacter metallireducens
    J. Bacteriol. 194 (10), 2501 - 2508
    Volltext (URL)
  • Pohler, P., Lehmann, J., Veneruso, V., Tomm, J., von Bergen, M., Lambrecht, B., Kohn, B., Weingart, C., Müller, T.H., Seltsam, A. (2012):
    Evaluation of the tolerability and immunogenicity of ultraviolet C-irradiated autologous platelets in a dog model
    Transfusion 52 (11), 2414 - 2426
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  • Reinhold, A., Westermann, M., Seifert, J., von Bergen, M., Schubert, T., Diekert, G. (2012):
    Impact of vitamin B12 on the formation of the tetrachloroethene reductive dehalogenase in Desulfitobacterium hafniense strain Y51
    Appl. Environ. Microb. 78 (22), 8025 - 8032
    Volltext (URL)
  • Salbach, J., Kliemt, S., Rauner, M., Rachner, T.D., Goettsch, C., Kalkhof, S., von Bergen, M., Möller, S., Schnabelrauch, M., Hintze, V., Scharnweber, D., Hofbauer, L.C. (2012):
    The effect of the degree of sulfation of glycosaminoglycans on osteoclast function and signaling pathways
    Biomaterials 33 (33), 8418 - 8429
    Volltext (URL)
  • Seifert, J., Taubert, M., Jehmlich, N., Schmidt, F., Völker, U., Vogt, C., Richnow, H.H., von Bergen, M. (2012):
    Protein-based stable isotope probing (protein-SIP) in functional metaproteomics
    Mass Spectrom. Rev. 31 (6), 683 - 697
    Volltext (URL)
  • Taubert, M., Vogt, C., Wubet, T., Kleinsteuber, S., Tarkka, M.T., Harms, H., Buscot, F., Richnow, H.-H., von Bergen, M., Seifert, J. (2012):
    Protein-SIP enables time-resolved analysis of the carbon flux in a sulfate-reducing, benzene-degrading microbial consortium
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