Dr. Johannes Schmidt

Postdoc in der Functional Genomics Gruppe

Kontakt


Department für Molekulare Systembiologie (MOLSYB)

Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung - UFZ
Permoserstr. 15
04318 Leipzig, Germany

Tel: 0341 235 1354 
johannes.schmidt@ufz.de

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Wissenschaftsnetzwerke


ResearchGate
ORCiD


Forschungsschwerpunkte


  • Funktionelle proteomische Analysen im Aktivierungsverlauf von Immunzellen
  • Integrative Transcriptomics und Proteomics zur Identifizierung von bisher unbekannten Proteinen
  • Weiterentwicklung von analytischen Methoden zur Untersuchung von posttranslationalen Modifikationen (PTM)
  • Nutzung verschiedener nanoLC-MS Systeme (z.B. Q Exactive HF, Triple Quad 5500)


Lebenslauf



Seit 01-2017

Wissenschaftlicher Mitarbeiter/Postdoc im Department für Molekulare Systembiologie (MOLSYB) am Helmholtz-Zentrum, für Umweltforschung

10-2013 - 12-2016

Doktorand im Department für Molekulare Systembiologie (ehemals Department für Proteomik) am Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung

09-2013

Wissenschaftliche Hilfskraft im Department für Proteomik am Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung – UFZ, Leipzig

10-2011 – 09-2013

Masterstudium im Studiengang „Mikrobiologie und Biochemie“ an der Universität Rostock

Methoden zur Gewinnung von Proteinextrakten aus Muskelgewebe für die 2D-Gel bzw. LC-MS-basierte Proteomanalyse“ am Proteom Zentrum Rostock

08-2011

Teilnahme und Präsentation der Bachelorarbeit in der „5th European Summer School – Proteomics Basics“ in Brixen, Italien

10-2008 – 09-2011

Bachelorstudium im Studiengang „Biowissenschaften“ an der Universität Rostock

Entwicklung proteinanalytischer Methoden zur Titerbestimmung therapeutischer Antikörper am Beispiel von Rituximab“ am Proteom Zentrum Rostock

07-2007

Abitur am John-Brinckman-Gymnasium in Güstrow


Publikationen


2018 (2)

  • Schmidt, J.R., Rücker-Braun, E., Heidrich, K., von Bonin, M., Stölzel, F., Thiede, C., Middeke, J.M., Ehninger, G., Bornhäuser, M., Schetelig, J., Schubert, K., von Bergen, M., Heidenreich, F., (2018):
    Pilot study on mass spectrometry–based analysis of the proteome of CD34+CD123+ progenitor cells for the identification of potential targets for immunotherapy in acute myeloid leukemia
    Proteomes 6 (1), art. 11
    Volltext (URL)
    Daten DOI
  • Thabet, A., Schmidt, J., Baumann, S., Honscha, W., von Bergen, M., Daugschies, A., Bangoura, B., (2018):
    Resistance towards monensin is proposed to be acquired in a Toxoplasma gondii model by reduced invasion and egress activities, in addition to increased intracellular replication
    Parasitology 145 (3), 313 - 325
    Volltext (URL)
    Daten DOI
    Daten DOI

2016 (2)

  • Förster, Y., Schmidt, J.R., Wissenbach, D.K., Pfeiffer, S.E.M., Baumann, S., Hofbauer, L.C., von Bergen, M., Kalkhof, S., Rammelt, S., (2016):
    Microdialysis sampling from wound fluids enables quantitative assessment of cytokines, proteins, and metabolites reveals bone defect-specific molecular profiles
    PLOS One 11 (7), e0159580
    Volltext (URL)
  • Schmidt, J.R., Kliemt, S., Preissler, C., Moeller, S., von Bergen, M., Hempel, U., Kalkhof, S., (2016):
    Osteoblast-released matrix vesicles, regulation of activity and composition by sulfated and non-sulfated glycosaminoglycans
    Mol. Cell. Proteomics 15 , 558 - 572
    Volltext (URL)

2014 (1)

  • Kalkhof, S., Förster, Y., Schmidt, J., Schulz, M.C., Baumann, S., Weißflog, A., Gao, W., Hempel, U., Eckelt, U., Rammelt, S., von Bergen, M., (2014):
    Proteomics and metabolomics for in situ monitoring of wound healing
    Biomed Res. Int. 2014 , art. 934848
    Volltext (URL)