Christian Schiffmann
Doktorand
Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung - UFZ
Department Proteomik
Permoserstr. 15
04318 Leipzig
Telefon: +49 341 235 1352
Fax: +49 341 235 1786
Forschungsschwerpunkt
Von einigen anaerob lebenden Bakterien ist bekannt, dass sie chlorierte Kohlenwasserstoffe und Aromaten enzymatisch dehalogenieren können und diesen Prozess zur Energiegewinnung nutzen. Neben dem wissenschaftlichen Interesse an der Erforschung dieses Vorganges, der sogenannten Organohalid-Respiration, in der Grundlagenforschung, treiben mögliche praktische Anwendungen die Untersuchungen voran. Die Reinigung von kontaminierten Böden nutzt einen Nebeneffekt dieser Stoffwechselreaktion: die dabei entstehenden Produkte sind meist weniger toxisch und persistent als die Ausgangstoffe.
Die Organohalid-Respiration wird im Verbund der DFG Forschergruppe FOR 1530 ausführlich untersucht. Meine Doktorarbeit ist dem Teilprojekt zugeordnet, welches sich mit der proteomischen Untersuchung von Organohalid-Respiration betreibenden Bakterien in Rein- und Mischkulturen befasst. In einem ersten Schritt soll die Probenvorbereitung und Proteinextraktion optimieren werden, sodass trotz geringer Biomassenausbeuten bei der anaeroben Kultivierung eine umfassende massenspektrometrische Analyse des Proteoms möglich ist. Nach Auswertung der Proteomanalysen erfolgt durch gezielte massenspektrometrische Untersuchung die exakte Quantifizierung der von den Organismen exprimierten reduktiven Dehalogenasen. Diese Schlüsselenzyme der Organohalid-Respiration sollen in Abhängigkeit vom metabolisierten Substrat untersucht werden.
Weitere Informationen zur DFG Forschergruppe 1530:
Methodenspektrum
- SDS-Gelelektrophorese
- Shotgun-Proteom Experimente: nanoAquity UPLC, LTQ Orbitrap
- Quantitative Massenspektrometrie: Selected reaction monitoring, QTrap 5500
Kooperationen
Im Rahmen der DFG Forschergruppe 1530 arbeiten folgende Institute zusammen:
- Friedrich-Schiller-Universität Jena, Institut für Mikrobiologie
- Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung – UFZ, Department Isotopenbiogeochemie
- TU Berlin, Fachgebiet Angewandte Biotechnologie
- Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, Institut für Biologie und Mikrobiologie
- Universität Leipzig, Institut für Biochemie
- Wageningen University, Laboratory of Microbiology
Lebenslauf
Seit 2011
Doktorand im Department Proteomik am Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung - UFZ
2010/2011
Diplomarbeit am Institut für Biochemie, Arbeitskreis Biotechnologie und Enzymkatalyse, Universität Greifswald
„Untersuchung zu Enzymreaktionen mit Pyruvatdecarboxylasen in überkritischem Kohlenoxid“
2005 - 2011
Biochemiestudium an der Ernst-Moritz-Arndt-Universität Greifswald
2004
Abitur am Gymnasium Steglitz, Berlin