Funktionales Metaproteom der Mikrobiota
Projektbeschreibung
Aktuelle Untersuchungen zeigen, dass die Zusammensetzung der Mikroflora im Gastrointestinaltrakt zur Entwicklung und Ausprägung der Adipositas beiträgt. Weiterführende Studien zeigten eine Änderung der Mikroflora nach bariatrisch chirurgischer Intervention. Jedoch sind weder die zu Grunde liegenden Mechanismen noch ihre Folgen für die Energiehomöostase hinreichend geklärt.
Im Projekt soll der Einfluss bariatrischer Interventionsverfahren im Ratten-Modell auf die Mikroflora und deren Stoffwechsel, und der Einfluss auf den Wirtorganismus geprüft werden. Die Zusammensetzung der Mikroflora wird prospektiv nach 1 Woche, 4 Wochen und 24 Wochen post-interventionell bestimmt. Die Untersuchung der Mikroflora erfolgt auf den Ebenen des Mikrobioms durch genetische Analysen und mittels Bestimmung der Stoffwechselaktivität durch Messung des 13C-Kohlenstoffflusses im Proteom der Mikroflora. Weiterführende Gewebeanalysen sollen Einblicke auf die Zusammenhänge zwischen der Mikroflora und dem Stoffwechsel des Rezipienten gewähren.
Zusammenfassend wird durch die Untersuchung definiert, welchen Einfluss die bariatrische Chirurgie auf die Mikroflora des Gastrointestinaltraktes hat, und welche Interaktionen zum Organismus des Rezipienten bestehen.
Abb.1 Analyse des Mikrobiota-Proteoms und des Gewebe-Proteoms mittels Protein-SIP
Beteiligte Wissenschaftler
Kooperationen
Dr. Manuel Ferrer, CSIC, Institute of Catalysis, Madrid, Spain
Prof. Antonio Suarez, Department of Biochemistry and Molecular Biology, Centro de Investigación Biomédica, University of Granada, Granada, Spain
Publikationen
Haange SB, Oberbach A, Schlichting N, Hugenholtz F, Smidt H, von Bergen M, Till H, Seifert J. (2012)
Metaproteome analysis and molecular genetics of rat intestinal microbiota reveals section and localization resolved species distribution and enzymatic functionalities.
Journal of Proteome Research 11 (11), 5406-5417
Ferrer M, Ruiz A, Lanza F, Haange SB, Oberbach A, Till H, Campoy C, Segura MT, Richter M, Bargiela R, von Bergen M, Seifert J, Suarez A. (2013)
Microbiota from the distal guts of lean and obese adolescents exhibit partial functional redundancy besides clear differences in community structure.
Environmental Microbiology 15 (1), 211-226.
Pérez-Cobas AE, Gosalbes MJ, Friedrichs A, Knecht H, Artacho A, Eismann K, Otto W, Rojo D, Bargiela R, von Bergen M, Neulinger SC, Däumer C, Heinsen FA, Latorre A, Barbas C, Seifert J, Martins dos Santos V, Ott SJ, Ferrer M, Moya A. (in press)
Gut microbiota disturbance during antibiotic therapy: a multi-omic approach.
Gut (doi: 10.1136/gutjnl-2012-303184)
Förderung
IFB Adipositas Erkrankungen, Uniklinkium Leipzig